Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sun3Q5SS91 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms