Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmprss11eQ5S248 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms