Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm2Q5FW85 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms