Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt2Q5DTW2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt2Q5DTW2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms