Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms