Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chsy3Q5DTK1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chsy3Q5DTK1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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