Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bdp1Q571C7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bdp1Q571C7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms