Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms