Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms