Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt35Q497I4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms