Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Lrrc43Q3V0L5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Lrrc43Q3V0L5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Lrrc43Q3V0L5 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc43Q3V0L5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms