Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim80Q3V061 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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