Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9Q3V038 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms