Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Prdm6Q3UZD5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm6Q3UZD5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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