Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc114Q3UX62 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms