Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn4Q3UWL8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn4Q3UWL8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms