Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1d1Q3UV55 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms