Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B230104I21RikQ3USW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms