Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms