Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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