Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms