Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef40Q3UPH7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms