Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrc4Q3UP24 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms