Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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