Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc34Q3UI66 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms