Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx27Q3UHD6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx27Q3UHD6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms