Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDV9

Gm10577, Predicted gene 10577 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10577Q3UDV9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10577Q3UDV9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10577Q3UDV9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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