Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pid1Q3UBG2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms