Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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Rnf180Q3U827 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Rnf180Q3U827 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf180Q3U827 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms