Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U595 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q3U595 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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