Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gse1Q3U3C9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms