Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kdm4dQ3U2K5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kdm4dQ3U2K5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kdm4dQ3U2K5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kdm4dQ3U2K5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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