Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LcorlQ3U285 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LcorlQ3U285 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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LcorlQ3U285 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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LcorlQ3U285 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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LcorlQ3U285 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorlQ3U285 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms