Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms