Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms