Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srsf6Q3TWW8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms