Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccndbp1Q3TVC7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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