Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTJ4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms