Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTA7

Cblb, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CblbQ3TTA7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CblbQ3TTA7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CblbQ3TTA7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CblbQ3TTA7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CblbQ3TTA7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CblbQ3TTA7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CblbQ3TTA7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CblbQ3TTA7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms