Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRG0

Gm1604b, Gene model 1604B, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1604bQ3TRG0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm1604bQ3TRG0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms