Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc102aQ3TMW1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms