Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf3c3Q3TMP1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms