Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca4Q3TKT4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms