Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms