Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms