Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccbe1Q3MI99 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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