Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3KNL4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3KNL4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms