Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shroom4Q1W617 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms