Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim71Q1PSW8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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