Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam171bQ14CH0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam171bQ14CH0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms